Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaraP11416 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaraP11416 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaraP11416 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaraP11416 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaraP11416 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RaraP11416 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RaraP11416 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RaraP11416 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaraP11416 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaraP11416 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaraP11416 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaraP11416 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaraP11416 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaraP11416 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaraP11416 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaraP11416 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaraP11416 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaraP11416 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RaraP11416 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RaraP11416 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaraP11416 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaraP11416 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaraP11416 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaraP11416 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaraP11416 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaraP11416 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaraP11416 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaraP11416 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaraP11416 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaraP11416 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaraP11416 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaraP11416 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RaraP11416 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RaraP11416 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RaraP11416 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RaraP11416 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RaraP11416 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RaraP11416 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RaraP11416 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RaraP11416 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RaraP11416 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaraP11416 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaraP11416 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaraP11416 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaraP11416 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaraP11416 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaraP11416 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RaraP11416 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RaraP11416 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaraP11416 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaraP11416 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaraP11416 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RaraP11416 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RaraP11416 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RaraP11416 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RaraP11416 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaraP11416 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms