Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolP11369 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolP11369 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolP11369 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolP11369 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolP11369 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolP11369 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolP11369 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolP11369 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolP11369 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PolP11369 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PolP11369 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PolP11369 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PolP11369 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PolP11369 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PolP11369 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PolP11369 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolP11369 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PolP11369 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolP11369 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PolP11369 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PolP11369 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PolP11369 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PolP11369 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PolP11369 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PolP11369 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PolP11369 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PolP11369 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolP11369 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PolP11369 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PolP11369 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PolP11369 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PolP11369 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PolP11369 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PolP11369 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PolP11369 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PolP11369 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PolP11369 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PolP11369 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PolP11369 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PolP11369 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PolP11369 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PolP11369 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PolP11369 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PolP11369 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PolP11369 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PolP11369 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PolP11369 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PolP11369 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PolP11369 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PolP11369 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PolP11369 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PolP11369 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PolP11369 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PolP11369 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PolP11369 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PolP11369 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolP11369 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PolP11369 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms