Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl1P10146 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl1P10146 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl1P10146 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms