Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alkbh1P0CB42 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alkbh1P0CB42 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alkbh1P0CB42 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alkbh1P0CB42 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alkbh1P0CB42 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alkbh1P0CB42 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms