Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pax1P09084 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax1P09084 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pax1P09084 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pax1P09084 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pax1P09084 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pax1P09084 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pax1P09084 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pax1P09084 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pax1P09084 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms