Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spta1P08032 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spta1P08032 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spta1P08032 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spta1P08032 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spta1P08032 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spta1P08032 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spta1P08032 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spta1P08032 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spta1P08032 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spta1P08032 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spta1P08032 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spta1P08032 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spta1P08032 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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