Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt4P07744 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt4P07744 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt4P07744 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt4P07744 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt4P07744 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt4P07744 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt4P07744 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt4P07744 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt4P07744 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt4P07744 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt4P07744 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms