Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06329 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P06329 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06329 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06329 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06329 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06329 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06329 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06329 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06329 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06329 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06329 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06329 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06329 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06329 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P06329 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06329 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06329 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06329 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06329 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06329 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06329 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06329 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06329 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06329 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06329 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06329 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06329 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06329 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06329 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06329 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06329 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06329 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06329 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06329 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms