Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06321 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06321 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06321 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06321 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06321 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06321 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06321 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06321 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06321 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P06321 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
P06321 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06321 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06321 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06321 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06321 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06321 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06321 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06321 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06321 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06321 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P06321 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P06321 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06321 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06321 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06321 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P06321 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06321 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06321 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06321 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06321 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P06321 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
P06321 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P06321 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P06321 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P06321 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
P06321 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P06321 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P06321 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P06321 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms