Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Got1P05201 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Got1P05201 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Got1P05201 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Got1P05201 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Got1P05201 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Got1P05201 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Got1P05201 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Got1P05201 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Got1P05201 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Got1P05201 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Got1P05201 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Got1P05201 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Got1P05201 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Got1P05201 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Got1P05201 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Got1P05201 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Got1P05201 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Got1P05201 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Got1P05201 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Got1P05201 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Got1P05201 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Got1P05201 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Got1P05201 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Got1P05201 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Got1P05201 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Got1P05201 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Got1P05201 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Got1P05201 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Got1P05201 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Got1P05201 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Got1P05201 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Got1P05201 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Got1P05201 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Got1P05201 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Got1P05201 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Got1P05201 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Got1P05201 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Got1P05201 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Got1P05201 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Got1P05201 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Got1P05201 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Got1P05201 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Got1P05201 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Got1P05201 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Got1P05201 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Got1P05201 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Got1P05201 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Got1P05201 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Got1P05201 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Got1P05201 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Got1P05201 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Got1P05201 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Got1P05201 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Got1P05201 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Got1P05201 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Got1P05201 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Got1P05201 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Got1P05201 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Got1P05201 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms