Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01837 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01837 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01837 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01837 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01837 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01837 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01837 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01837 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01837 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01837 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01837 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01837 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01837 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01837 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01837 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01837 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01837 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01837 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01837 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01837 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01837 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01837 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01837 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01837 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01837 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01837 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01837 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01837 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01837 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01837 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01837 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01837 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01837 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01837 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms