Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01652 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P01652 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01652 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01652 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01652 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01652 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01652 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01652 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01652 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P01652 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01652 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01652 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01652 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01652 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01652 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01652 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01652 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01652 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P01652 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01652 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01652 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01652 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01652 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01652 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01652 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01652 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
P01652 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01652 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01652 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01652 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01652 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01652 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01652 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01652 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01652 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01652 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01652 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01652 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01652 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01652 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01652 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01652 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01652 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01652 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01652 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01652 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01652 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01652 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01652 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01652 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01652 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01652 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01652 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01652 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01652 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01652 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01652 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01652 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01652 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01652 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01652 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01652 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01652 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01652 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01652 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01652 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01652 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01652 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01652 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01652 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01652 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01652 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01652 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01652 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01652 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01652 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01652 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01652 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms