Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifnb1P01575 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifnb1P01575 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifnb1P01575 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifnb1P01575 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms