Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Actn3O88990 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Actn3O88990 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Actn3O88990 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Actn3O88990 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Actn3O88990 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Actn3O88990 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Actn3O88990 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Actn3O88990 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms