Protein–RNA interactions for Protein: O88410

Cxcr3, C-X-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr3O88410 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr3O88410 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr3O88410 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr3O88410 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcr3O88410 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms