Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc4a4O88343 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc4a4O88343 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc4a4O88343 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc4a4O88343 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc4a4O88343 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc4a4O88343 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms