Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mid1O70583 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mid1O70583 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1O70583 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mid1O70583 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mid1O70583 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mid1O70583 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mid1O70583 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mid1O70583 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mid1O70583 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mid1O70583 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mid1O70583 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms