Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtssO70370 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtssO70370 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CtssO70370 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CtssO70370 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtssO70370 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtssO70370 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CtssO70370 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtssO70370 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtssO70370 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtssO70370 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CtssO70370 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CtssO70370 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtssO70370 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtssO70370 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CtssO70370 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtssO70370 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CtssO70370 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CtssO70370 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtssO70370 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtssO70370 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtssO70370 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CtssO70370 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtssO70370 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CtssO70370 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtssO70370 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtssO70370 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtssO70370 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtssO70370 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtssO70370 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtssO70370 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtssO70370 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CtssO70370 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtssO70370 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtssO70370 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtssO70370 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtssO70370 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtssO70370 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtssO70370 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtssO70370 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CtssO70370 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtssO70370 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtssO70370 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtssO70370 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtssO70370 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtssO70370 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtssO70370 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CtssO70370 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtssO70370 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtssO70370 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtssO70370 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtssO70370 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtssO70370 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CtssO70370 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms