Protein–RNA interactions for Protein: O70361

Per3, Period circadian protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per3O70361 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per3O70361 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per3O70361 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Per3O70361 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per3O70361 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per3O70361 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per3O70361 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Per3O70361 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per3O70361 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per3O70361 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Per3O70361 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per3O70361 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Per3O70361 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per3O70361 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per3O70361 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Per3O70361 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Per3O70361 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per3O70361 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per3O70361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per3O70361 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per3O70361 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per3O70361 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Per3O70361 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per3O70361 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Per3O70361 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Per3O70361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per3O70361 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per3O70361 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Per3O70361 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per3O70361 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Per3O70361 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per3O70361 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per3O70361 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per3O70361 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Per3O70361 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Per3O70361 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per3O70361 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per3O70361 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Per3O70361 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Per3O70361 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per3O70361 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per3O70361 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Per3O70361 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Per3O70361 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per3O70361 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per3O70361 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per3O70361 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Per3O70361 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Per3O70361 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per3O70361 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per3O70361 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per3O70361 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Per3O70361 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per3O70361 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per3O70361 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per3O70361 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per3O70361 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per3O70361 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per3O70361 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per3O70361 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per3O70361 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per3O70361 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per3O70361 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per3O70361 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per3O70361 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per3O70361 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per3O70361 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per3O70361 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per3O70361 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms