Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxq1O70220 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxq1O70220 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxq1O70220 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxq1O70220 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxq1O70220 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxq1O70220 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxq1O70220 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxq1O70220 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxq1O70220 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxq1O70220 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxq1O70220 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxq1O70220 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxq1O70220 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxq1O70220 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxq1O70220 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxq1O70220 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxq1O70220 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxq1O70220 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Foxq1O70220 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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