Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mmp8O70138 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mmp8O70138 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mmp8O70138 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mmp8O70138 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mmp8O70138 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mmp8O70138 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Mmp8O70138 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mmp8O70138 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Mmp8O70138 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mmp8O70138 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Mmp8O70138 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Mmp8O70138 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mmp8O70138 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mmp8O70138 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mmp8O70138 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mmp8O70138 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mmp8O70138 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mmp8O70138 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mmp8O70138 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms