Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb5O55234 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb5O55234 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb5O55234 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb5O55234 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms