Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChadO55226 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChadO55226 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChadO55226 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChadO55226 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChadO55226 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChadO55226 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChadO55226 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChadO55226 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChadO55226 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChadO55226 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChadO55226 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChadO55226 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChadO55226 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ChadO55226 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChadO55226 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChadO55226 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChadO55226 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChadO55226 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChadO55226 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChadO55226 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChadO55226 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChadO55226 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChadO55226 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ChadO55226 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChadO55226 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChadO55226 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChadO55226 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChadO55226 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChadO55226 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChadO55226 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChadO55226 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChadO55226 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChadO55226 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChadO55226 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChadO55226 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChadO55226 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChadO55226 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChadO55226 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChadO55226 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChadO55226 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChadO55226 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChadO55226 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChadO55226 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChadO55226 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChadO55226 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChadO55226 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ChadO55226 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChadO55226 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChadO55226 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ChadO55226 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChadO55226 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChadO55226 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChadO55226 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChadO55226 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ChadO55226 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChadO55226 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChadO55226 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChadO55226 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ChadO55226 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChadO55226 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms