Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IlkO55222 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IlkO55222 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IlkO55222 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IlkO55222 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IlkO55222 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IlkO55222 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IlkO55222 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IlkO55222 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IlkO55222 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IlkO55222 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IlkO55222 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IlkO55222 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IlkO55222 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IlkO55222 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IlkO55222 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IlkO55222 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IlkO55222 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IlkO55222 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IlkO55222 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IlkO55222 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IlkO55222 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IlkO55222 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IlkO55222 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IlkO55222 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IlkO55222 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IlkO55222 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IlkO55222 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IlkO55222 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IlkO55222 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IlkO55222 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IlkO55222 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IlkO55222 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IlkO55222 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IlkO55222 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IlkO55222 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IlkO55222 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IlkO55222 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IlkO55222 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IlkO55222 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IlkO55222 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IlkO55222 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IlkO55222 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IlkO55222 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IlkO55222 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IlkO55222 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IlkO55222 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IlkO55222 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IlkO55222 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IlkO55222 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IlkO55222 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IlkO55222 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IlkO55222 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IlkO55222 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IlkO55222 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IlkO55222 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IlkO55222 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IlkO55222 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IlkO55222 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IlkO55222 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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