Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl35aO55142 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl35aO55142 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl35aO55142 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms