Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eif6O55135 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif6O55135 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eif6O55135 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif6O55135 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eif6O55135 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif6O55135 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Eif6O55135 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eif6O55135 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif6O55135 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif6O55135 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Eif6O55135 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif6O55135 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif6O55135 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Eif6O55135 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif6O55135 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Eif6O55135 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Eif6O55135 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms