Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nck2O55033 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nck2O55033 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nck2O55033 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nck2O55033 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nck2O55033 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nck2O55033 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nck2O55033 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nck2O55033 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nck2O55033 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms