Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bnip3O55003 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bnip3O55003 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bnip3O55003 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Bnip3O55003 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip3O55003 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms