Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dnajb6O54946 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Dnajb6O54946 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnajb6O54946 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnajb6O54946 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnajb6O54946 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms