Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarce1O54941 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarce1O54941 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarce1O54941 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarce1O54941 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms