Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itgb3O54890 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb3O54890 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb3O54890 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms