Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FxnO35943 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FxnO35943 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FxnO35943 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FxnO35943 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FxnO35943 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FxnO35943 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FxnO35943 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FxnO35943 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FxnO35943 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FxnO35943 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FxnO35943 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FxnO35943 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FxnO35943 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FxnO35943 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FxnO35943 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FxnO35943 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FxnO35943 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FxnO35943 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FxnO35943 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FxnO35943 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FxnO35943 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FxnO35943 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FxnO35943 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FxnO35943 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FxnO35943 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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FxnO35943 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FxnO35943 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FxnO35943 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FxnO35943 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FxnO35943 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FxnO35943 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FxnO35943 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FxnO35943 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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FxnO35943 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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FxnO35943 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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FxnO35943 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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FxnO35943 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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FxnO35943 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FxnO35943 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FxnO35943 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FxnO35943 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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FxnO35943 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FxnO35943 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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FxnO35943 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FxnO35943 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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FxnO35943 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FxnO35943 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FxnO35943 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FxnO35943 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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