Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnd2O35927 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnd2O35927 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnd2O35927 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms