Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3cdO35904 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3cdO35904 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Pik3cdO35904 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pik3cdO35904 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pik3cdO35904 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms