Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Cited2O35740 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited2O35740 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited2O35740 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited2O35740 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited2O35740 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cited2O35740 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited2O35740 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited2O35740 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited2O35740 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited2O35740 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cited2O35740 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited2O35740 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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