Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phox2bO35690 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Phox2bO35690 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phox2bO35690 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phox2bO35690 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phox2bO35690 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms