Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx1aO35526 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stx1aO35526 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1aO35526 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx1aO35526 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms