Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn6O35454 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn6O35454 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn6O35454 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcn6O35454 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcn6O35454 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms