Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pld3O35405 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld3O35405 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld3O35405 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pld3O35405 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pld3O35405 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pld3O35405 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld3O35405 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pld3O35405 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pld3O35405 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pld3O35405 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms