Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srsf5O35326 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srsf5O35326 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srsf5O35326 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srsf5O35326 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srsf5O35326 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms