Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf11aO35305 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tnfrsf11aO35305 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf11aO35305 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfrsf11aO35305 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms