Protein–RNA interactions for Protein: O35257

Prl6a1, Prolactin-6A1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl6a1O35257 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl6a1O35257 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prl6a1O35257 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prl6a1O35257 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prl6a1O35257 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms