Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Pkd2O35245 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Pkd2O35245 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Pkd2O35245 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,7■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Pkd2O35245 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Pkd2O35245 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32,51■■■□□ 2,8
Pkd2O35245 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Pkd2O35245 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Pkd2O35245 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Pkd2O35245 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,9 ms