Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptpn9O35239 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpn9O35239 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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Ptpn9O35239 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
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Ptpn9O35239 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpn9O35239 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
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