Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kifc3O35231 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kifc3O35231 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kifc3O35231 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kifc3O35231 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms