Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Polr1aO35134 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Polr1aO35134 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Polr1aO35134 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Polr1aO35134 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Polr1aO35134 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Polr1aO35134 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms