Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ampd3O08739 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ampd3O08739 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ampd3O08739 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ampd3O08739 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ampd3O08739 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ampd3O08739 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms