Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AlyrefO08583 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AlyrefO08583 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AlyrefO08583 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AlyrefO08583 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AlyrefO08583 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms