Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna2d1O08532 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna2d1O08532 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d1O08532 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d1O08532 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms