Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2al1oL7MU04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2al1oL7MU04 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2al1oL7MU04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2al1oL7MU04 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms